Bei der Kompilierung von NIOS II C-Code in einer benutzerdefinierten Makefile beträgt die Variable "Long" 8 Byte. Beim Kompilieren der NIOS II Anwendung in NIOS II eclipse beträgt die Größe jedoch 4 Byte.
Die Möglichkeit, eine falsche Kompilierung über die benutzerdefinierte Makefile zu erstellen, stammt von der Verwendung von PC GCC ("x86_64-pc-cygwin"). Der richtige sollte jedoch "nios2-elf-gcc" sein.
Um dieses Problem zu vermeiden, verwenden Sie NIOS II SBT, um NIOS II-Anwendungen zu erstellen.