Es gibt ein Problem in Quartus® II Softwareversion 8.1, das den falschen PROGRAM Length Count (SPS) Wert in der verwendet. JIC-Datei, die für Stratix® III Geräte mit dem Serial Flash Loader (SFL) generiert wurde. Sie können versuchen, den WERT VON "S" anzupassen. In den meisten Fällen wird das Problem durch die Anpassung des WERTs "S" auf -8 behoben. Der WERT VON kann über das Register "Erweitert" im Fenster Programmierdatei konvertieren angepasst werden.
Dieses Problem wurde in Quartus II Softwareversion 9.0 behoben.