TDas .jam-Dateiformat speichert keine der Programmieroptionsauswahlen, die eingeschaltet wurden im Quartus® II Programmierer-Fenster. Im Quartus II Programmer-Fenster werden die Programmieroptionen beim Erstellen einer .jam-Datei ignoriert. Daher ist die .jam-Datei nicht in der Lage, Benutzern die Auswahl von Optionen wie Programm, Verifizierung, Leerüberprüfung oder Löschen auf einzelnen Geräten zu ermöglichen.
Beim Ausführen der .jam-Datei über das Jam-KONFIGURPL-Player, Sie können auswählen, welcher Vorgang angewendet werden soll. Wenn es sich jedoch um eine .jam-Datei mit mehreren Geräten handelt, gilt der von Ihnen gewählte Vorgang auf alle Geräte in der JTAG-Kette, da in der .jam-Datei für jedes Gerät eine Datendatei vorhanden ist.