Ja, bei der Auswahl des External PLL-Modus auf der nativen PHY Megawi außerhalb™ der Arria® V GX und Stratix® V GX-Geräte bleibt der tx_pll_refclk Port in den Quartus® II Softwareversionen 12.0 SP2 und früher als nutzbarer Port.
Im externen PLL-Modus sollten Sie nur ext_pll_clk Port verwenden und den tx_pll_refclk Port nicht angeschlossen lassen.
Dieses Problem wird in einer zukünftigen Version der Quartus II Software behoben.