Intel® Select Solutions für die Genomanalyse

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Fortschritte in der Genomforschung bieten neue Möglichkeiten, Krankheiten zu verstehen und Präzisionstherapien durchzuführen. Durch Verarbeiten, Speichern und Analysieren zunehmend umfangreicher Daten für die Genomsequenzierung werden neue Entdeckungen möglich. Im Jahr 2015 erreichte die für die Sequenzierung benötigte Datenspeicherkapazität ein Petabyte pro Jahr, und dieser Bedarf verdoppelt sich... auch weiterhin alle sieben Monate. Mit dieser Zuwachsrate wird die Genomsequenzierung in den nächsten fünf Jahren hunderte von Petabyte pro Jahr erzeugen und könnte bis 2025 annähernd ein Zettabyte pro Jahr an Datenspeicher erfordern.Das Broad Institute of MIT and Harvard (broadinstitute.org) ist mit jährlich ca. 24 TB an neuen Daten weltweit einer der größten Erzeuger von Humangenom-Daten. Gegenwärtig verwaltet das Broad Institute mehr als 50 PB Daten. Die Forscher benötigen die richtigen Tools, um diese enorme Datenmenge zeitnah analysieren zu können und entsprechende Erkenntnisse über Krankheiten und mögliche Behandlungsmethoden zu gewinnen. Zu diesen Tools zählt das Genome Analysis Toolkit* (GATK*), eine Sammlung führender Softwaremethoden, die vom Broad Institute entwickelt wurden und von der Mehrzahl der weltweiten Genforschungszentren anerkannt sind.2017 starteten Intel und das Broad Institute eine neue Initiative, das Intel-Broad Center for Genomic Data Engineering, eine auf fünf Jahre angelegte Kooperation der beiden Organisationen, die dem Zweck dient, den Ablauf der Prozesse in der Genomforschung mithilfe von Tools wie GATK, Burrow-Wheeler Aligner (BWA), Cromwell, Intel® Genomics Kernel Library (Intel® GKL), GenomicsDB* und anderen Techniken und Tools zu vereinfachen und zu beschleunigen.

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